В 1987-2000 г.г. гимназию возглавляла Каюмова Майя Дмитриевна.
С 2000 по 2011 года руководила педагогическим коллективом Акбашева Танзиля Махмутовна, Отличник просвещения Республики Башкортостан, Заслуженный учитель РБ.
С 2011 года по 2020 год гимназию возглавляла Лукьянова Флюра Анваровна, Отличник образования РФ.
С 2021 года по настоящее время директором МАОУ "Гимназия №64 имени В.В. Горбатко" является Белолапкина Инна Вячеславовна, Отличник образования РФ.
В настоящее время МАОУ "Гимназия №64 имени В.В. Горбатко"– успешное образовательное учреждение со своими устоявшимися традициями, сохранившее накопленный положительный опыт воспитания и образования подрастающего поколения. Успешность любого образовательного учреждения определяется качеством образования. В МАОУ "Гимназия №64 имени В.В. Горбатко" качество образования - это не только уровень знаний, умений, навыков выпускников, но качество всех процессов, происходящих в школе, начиная с оформления и оборудования классных комнат, учебных кабинетов, заканчивая образовательными технологиями и программами, используемыми педагогическим коллективом. Все в конечном счете влияет на уровень образования, которое оценивается в наше время как нравственными, так и рыночными категориями.
Средняя школа 64 получила статус гимназии в 1991 году, с тех пор осуществляет инновационную деятельность по следующим направлениям: использование инновационных образовательных технологий, информатизация образовательного пространства гимназии, работа с одаренными детьми. В декабре 2015 года ОУ переименовано в Муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение "Гимназия №64" городского округа город Уфа. В 2022 году гимназия переименована в Муниципальное автономное общеобразовательное учреждение "Гимназия №64" городского округа город Уфа. В 2023 году Муниципальное автономное общеобразовательное учреждение "Гимназия №64" переименована Муниципальное автономное общеобразовательное учреждение "Гимназия №64 имени Горбатко Виктора Васильевича"
Гимназия осуществляет сотрудничество с многими вузами города в различных формах. Преподаватели БГУ, БГПУ имени М. Акмуллы, УГНТУ, проводят учебные занятия с учащимися гимназии, что существенно влияет на повышение качества знаний учащихся. Ежегодно выпускники становятся студентами УГАТУ, УГНТУ. В последние годы всё больше выпускников становятся студентами Московских и Санкт-Петербургских вузов.
15 мая 2014 года в Гимназии состоялось торжественное мероприятие по случаю присвоения имени Горбатко В.В., дважды Героя Советского Союза, лётчика – космонавта СССР.
В 2015 г. по результатам Всероссийского конкурса ОУ «100 лучших школ России» г. Санкт-Петербург Гимназия №64 вошла в «100 лучших гимназий России».
Второй год по итогам Республиканского конкурса «30 лучших школ Башкортостана» гимназия входит в топ «30 лучших школ Башкортостана» (в 2015 г. - 20 место, в 2016 г. – 10 место).
Показателями успешности работы гимназии также являются стабильность 100-процентной успеваемости и позитивная динамика качества знаний обучающихся гимназии, успешная сдача ЕГЭ, поступаемость выпускников в ВУЗы, достижения в олимпиадном движении, НПК и др.
Материально-техническое оснащение позволяет осуществлять качественный образовательный процесс. Гимназия размещается в 2 корпусах (начальная и основная школа). Имеется 13 и 24 учебных кабинета, два компьютерных класса, лаборатории в кабинетах физики, химии, медицинский кабинет, актовый зал, столовая, спортивный зал, класс ритмики, библиотека, малый театральный зал. Проводится серьёзная работа по усовершенствованию материально-технической базы (оснащение кабинетов проекторами, экранами и т.д.). В настоящее время 67% кабинетов оснащены мультимедийным оборудованием, подключены к сети интернет, 20% - соединены локальной сетью. Педагоги активно используют электронные технологии образования.
Ежегодно учителя проходят КПК. Курсовая подготовка осуществляется в соответствии с перспективным планом по различным направлениям: ИРО РБ, БГПУ им. М. Акмуллы, БашГУ, НИМЦ, НОУ ДПО «Институт «АйТи», издательство «Лонгман», УМЦ МЧС РБ, ИГЛУ.
Учителя гимназии известны в республике, как профессионалы высочайшего уровня. Многие учителя являются членами экспертных комиссий по проверке ЕГЭ. Участвуя в различных профессиональных конкурсах, учителя гимназии, как правило, становятся победителями. Победители ПНПО РФ - Директор гимназии Лукьянова Ф.А., учитель английского языка Сизова Ю.М.., 4 учителя - победители республиканского этапа конкурса Учитель года.
Гимназия занимает социально активную позицию, педагоги участвуют в различных форумах, конференциях. На конференции «Современные образовательные модели и практики» в рамках Всероссийского педагогического фестиваля «Современное образование: опыт, инновации, перспективы» в г. Сочи обобщила опыт работы гимназии по формированию гуманистической модели образования.
В гимназии осуществляется профильное обучение (физико-математический, физико-химический, социально-экономический профили), изучается два иностранных языка (английский, французский, немецкий). Экспериментальная и инновационная деятельность осуществляется по теме «Формирование ключевых компетенций школьников в образовательном процессе», действует совместная с БГПУ кафедра иностранных языков и межкультурного взаимодействия.
Гимназия является базовой школой РАН, Ассоциированной школой союза машиностроителей, Ассоциированной школой ЮНЕСКО и успешно участвует в многочисленных проектах данных организаций. Также активно сотрудничает с Федерацией космонавтики, обществом Дружба «Башкортостан - Германия», «Альянс Франсез - Уфа» - участвует в важных проектах.
В качестве члена Содружества «Интеркинд» гимназия организует участие гимназистов в Республиканской олимпиаде на кубок ректора УГАТУ по физике, математике, обществознанию, информатике, английскому языку, немецкому языку (кубок по обществознанию, по математике).
Отмечается стабильная положительная динамика в олимпиадном движении, высокая результативность.
Гимназия ежегодно готовит победителей и призёров республики и заключительного этапа ВОШ РФ.
Кроме обязательных олимпиад гимназия вовлекает учащихся в большое количество открытых олимпиад и конкурсов. Массовым является участие в республиканской Гагаринской олимпиаде (проводится под патронатом Федерации космонавтики). Гимназия дважды стала обладателем кубка, как лидер по количеству призёров данной олимпиады
Организуется участие во Всероссийской олимпиаде «ФИЗТЕХ» МФТИ Московского физико-технического института (очно).
Исследовательской деятельности учащихся уделяется большое внимание. Первой ступенью является школьная НПК «Шаг в науку». Ежегодно большое количество проектов учащиеся защищают на НПК различного уровня. Республиканские НПК: «Ломоносовские чтения» г. Стерлитамак, НПК «Совёнок» г. Бирск; НПК «Фестиваль школьной науки» ЮНЕСКО, НПК «Татьянин день», Всероссийская НПК «Феринские чтения»
Большое внимание уделяется эстетическому, нравственному воспитанию, целенаправленно ведётся работа по привитию уважения к истории Отечества, традиционным цивилизационным ценностям. Ярким инновационным проектом гимназии является Исторический бал, который проводится в мае. Мероприятие имеет большой общественный резонанс, освещается в СМИ.
Гимназисты принимают активное участие в Патриотическом Образовательном проекте «Я гражданин Великой страны». 100% учащихся участвуют в Олимпиаде «Я горжусь», посвящённой ВОВ, в акции «Бессмертный полк».
Серьезным источником развития гимназии является воплощение принципа партнерства между педагогическим и ученическим и родительским коллективами при ведущей роли педагогического коллектива (большинство мероприятий учебного процесса и особенно внеурочной деятельности планируется и организуется в тесном сотрудничестве, организованы психологические тренинги для родителей).
Большую роль в активизации познавательного интереса учащихся играют организуемые в гимназии декадники. На протяжении нескольких лет самыми яркими, насыщенными являются декадники по истории и иностранным языкам.
Многочисленные мероприятия, системная работа коллектива гимназии способствуют реализации комплексно-целевой программы работы с одарёнными детьми, расширению сферы сотрудничества гимназии с учебными учреждениями, повышению квалификационного уровня педагогов, и в итоге - реализации миссии гимназии (создание образовательного пространства, которое позволит обеспечить личностный рост обучающихся и их подготовку к полноценному и эффективному участию в общественной и профессиональной жизни в условиях информатизации общества).
Гимназия 64 гордится каждым выпуском. Ежегодно почти все выпускники поступают в выбранные вузы республики и страны, продолжая хорошую и отличную учебу по выбранной специальности.
В свое время учились в гимназии, чемпионы спортсмены мирового уровня Сергей и Ирек Гимаевы.
Закончил "Гимназию №64" выпускник Марат Гузаиров (профессор, ректор УГАТУ (до 2015 г.)
В УГНТУ работает старшим преподавателем кандидат математических наук Илья Кутуков, выпускник 1991 года.